1月27日—30日 中国伊斯兰教第七次全国代表会议在京召开。来自全国各民族的伊斯兰教界代表以及教育、学术、经济等各界的穆斯林特邀代表共324人出席了会议。全国人大常 委会副委员长铁木尔·达瓦买提，国务委员司马义·艾买提，全国政协副主席白立忱、中共中央统战部副部长、国家民委主任李德洙，国家宗教局局长叶小文等领导 出席会议。会议选举产生了中国伊协第七届委员会委员238人，常委54人;选举陈广元为会长，刘书祥、余振贵(兼秘书长)、马云福、夏米西丁、马忠杰等 17人为副会长。会议期间还召开了全国百座模范清真寺表彰大会。

1月31日 中共中央政治局常委、全国政协主席李瑞环在人民大会堂会见了出席中国伊斯兰教第七次全国代表会议的全体代表新一届伊协领导班子成员。

1月31日 中共中央政治局常委、全国政协主席李瑞环邀请全国宗教团体领导人到中南海举行迎春座谈会。中国伊协会长陈广元、副会长刘书祥、余振贵等出席座谈会。

1月 派出刘志亮等4位年轻伊玛目参加在埃及爱资哈尔大学举行的第48期国际伊玛目进修班。

2月16日—31日 以宰南为团长的阿联酋市政局清真屠宰委员会考察团一行三人来华访问。先后考察了北京、河北、山东、上海等地的十余个清真食品厂家生产情况。

2月23日—3月29日 2000年朝觐工作开始。中国伊协派出以副会长马云福为团长、副秘书长洪长有为秘书长、国际部副主任文舰为副秘书长，陈玉龙、海永龙、虎志坚、张文炜为团 员的11人朝觐工作团，以副会长谢生林为团长的15人中国伊协朝觐团与来自全国各地有组织的2200余名穆斯林赴沙完成朝觐功课。

3月6日—4月9日 中国伊协全面贯彻中国伊斯兰教第七次全国代表会议精神，集中时间组织干部职工学习李瑞环主席讲话和叶小文局长讲话，在协会内深入开展调研工作，逐步改善和提高伊协工作管理水平，向全体工作人员提出“外树形象，内强素质”的要求。

3月15日 中国伊协在北京饭店举办古尔邦节招待会。全国人大副委员长铁木尔·达瓦买提，国务委员司马义·艾买提，全国政协副主席白立忱，外交部副部长吉佩定，国家宗教局副局长杨同祥等领导出席招待会。

3月21日 中国伊协顾问、原副会长、著名回族历史学家哲玛鲁丁·白寿彝教授在北京归真，享年91岁。

3月24日 应国家宗教事务局邀请来华访问的挪威宗教代表团一行7人拜访中国伊协。

3月 中国经学院领导班子经过调整，由陈广元任院长，宛耀宾任常务副院长，余振贵、夏米西丁、杨宗山任副院长。

3月 中国伊协举办第五期留学生培训班。

4月10日—27日 中国伊协组织对工作人员1999年度工作情况进行考核，在干部中组织学习江总书记“三个代表”的重要思想。

5月16日—19日 第三届全国“卧尔兹”演讲比赛在京举行。共有25个省、市、自治区，以及中国伊斯兰教经学院、新疆生产建设兵团推荐的92人参加了初赛，有54名选手参加在北京举行的正式比赛。

5月28日 马贤顾问应日本伊斯兰教中心的邀请，出席了“远东与伊斯兰世界：日本与伊斯兰的关系”国际研讨会。

6月2日 中国经学院组织举办了首届学生运动会。

6月24日 伊朗总统赛义德·穆罕默德·哈塔米在钓鱼台国宾馆会见了中国伊协会长陈广元、副会长刘书祥、余振贵、马云福、夏米西丁。

6月7日—20日 应伊朗“促进伊斯兰教派世界研究中心”秘书长胡拉萨尼长老的邀请，中国伊协会长陈广元等2人出席在伊朗德黑兰召开的第十三届“国际伊斯兰团结大会”。本次大会的主题是：伊斯兰民族的悲伤和希望。

6月11日—14日 应埃及伊斯兰事务最高理事会主席、宗教基金部部长马哈茂德·哈穆迪·泽格祖博士的邀请，中国伊协副会长夏米西丁、国际部副主任文舰出席埃及伊斯兰事务最高 理事会第十二届会议。本次大会主题是：伊斯兰教与时代的变迁。议题是：面向振兴伊斯兰世界文明工程。

6月 国际部副主任阿迪力随同国务委员司马仪•艾买提赴叙利亚参加阿萨德总统的葬礼。

6月 中国伊协全面启动“伊斯兰教务指导委员会”的筹备工作。

7月10日 中国伊协及时向中央统战部、国家宗教局等有关领导部门汇报河南省周口市地区政府强行拆迁回民公墓问题，促使这一事件得到妥善解决。

7月22日——24日 国家宗教事务局在青海省西宁市召开了穆斯林散居区伊斯兰教工作座谈会，中国伊协派员参加了会议。

7月31日—8月2日 中国经学院分别在昆明、乌鲁木齐、北京三地举行本科班招生考试，从23个省市的122名考生中择优录取新生25名。

8月28日—9月18日 中国伊协根据穆斯林群众反映，处理浙江杭州市《钱江晚报》和中国轻工业出版社对穆斯林不吃猪肉的原因有错误叙述的严重问题。

8月22日—28日 应港澳特区伊斯兰教组织联合邀请，刘书祥副会长率14人组成的中国伊协代表团对港澳特区进行了访问。

8月28日—31日 中国伊协会长陈广元作为中国代表团成员，出席了联合国在美国纽约召开的世界宗教和精神领袖千年和平大会，并在美国加州大学举办的“中国宗教发展论坛”上发表演讲。

8月 中国伊协举办选拔伊玛目培训班。

9月18日—21日 应利比亚世界伊斯兰宣教协会秘书长的邀请，中国伊协副秘书长杨志波、国际部副主任阿迪力二人出席了利比亚在印尼雅加达召开的利宣协第五届大会。大会推选杨志波担任世界宣教理事会理事职务。

9月19日 马来西亚马六甲州州长威位阿里鲁士淡一行拜访中国伊协。

9月20日 山东阳信事件发生后，中国伊协与各地伊协组织一起配合党和政府从事疏导工作。

9月25日 中国伊协顾问沈遐熙向年轻时期工作过的甘肃省张家川县东部民族贫困山区的闫家、马鹿、恭门、张良4个乡的6所学校的贫困学生，捐赠价值1.5万元的556双运动鞋。

9月30日—10月2日 应沙特朝觐部的邀请，中国伊协副会长马云福、国际部副主任阿迪力二人出席了在吉隆坡召开的首届朝觐组织培训工作国际会议。

9月 应乌兹别克斯坦塔什干大学的邀请，夏米西丁副会长出访乌兹别克斯坦。

10月9日—11月10日 中国经学院举办了“第一期新疆伊玛目研修班”。

10月13日 以伊朗圣训大学校长、伊朗朝觐总团团长穆罕默德·穆·沙赫利率领的伊朗学者代表团拜访中国伊协。

10月13日 沙特阿拉伯王国第二副首相兼国防和航天大臣苏丹·本·阿卜杜勒·阿齐兹亲王在钓鱼台国宾馆会见中国伊协副会长刘书祥、余振贵、马云福、夏米西丁。

10月18日—21日 应马来西亚马六甲州政府的邀请，中国伊协副会长兼秘书长余振贵、国际部副主任阿地力二人出席了马来西亚马六甲州召开的“马来文化与伊斯兰世界大会”。

10月 香港回教基金总会代表团一行6人来内地，参观访问了北京、天津、河北、山东等地。

10月 受国家宗教局委托，中国伊协在昆明召开有中央有关部委和八省区参加的全国朝觐工作协调会议，形成并通过了“会议记要”、《带队干部责任书》、《朝觐人员保证书》、《中国伊协倡议书》。

11月3日—11月10日 应巴基斯坦旁遮普省教育出版委员会主席穆罕默德·阿扎尔·塔希尔先生的邀请，中国伊协编辑部副主任李文彩、图书馆馆长陈进惠参加巴基斯坦第三届国际书法艺术比赛，并双双获得一等奖。

11月7日 国务委员司马义·艾买提接见“第一期新疆伊玛目研修班”全体学员并作了重要讲话。

11月28日—29日 中国伊协召开“王静斋爱国爱教思想研讨会”，纪念王静斋阿訇诞辰120周年暨归真50周年。来自七个省市的32位专家学者及宗教界人士参加了研讨会，并编 发了《王静斋纪念文集》，收入与会者提供的17篇文章。在开幕式上，举行了“乌思尧先生手抄汉译《古兰经》捐赠仪式”。

11月 派出北京经学院教师田进义等二人，参加马来西亚进行的第42届国际《古兰经》诵读比赛。

12月1日 中国伊协在北京国际饭店举行开斋节晚宴，邀请各伊斯兰国家驻华使节共进开斋饭。

12月21日 中央统战部、国家民委、国家宗教局转发《中国伊协致各省、市、自治区伊协的电报》，说服广大穆斯林群众不信谣，要珍视当前的大好局面，提高法制观念，发扬中国穆斯林顾全大局，维护团结的优良传统。在党中央、国务院的高度重视下，“阳信事件”得到妥善处理。

12月26日 中国伊协在西苑饭店举行“首都各族穆斯林喜迎开斋节”招待会。受党中央、国务院委托，国务委员司马义·艾买提，全国政协副主席、中共中央统战部部长王兆国出席招待会并看望各界穆斯林朋友。

12月 中国伊协邀请埃及2名诵经师来华，在北京、河北、河南等地进行诵经活动。